高校生(伊達京介)某夜看到母親倒在血泊中，母親在向京介說了一句抱歉後以刀刺中他的心臟。京介清醒後遇到一位叫岬真夜的女性，真夜從墳墓中將他救出，對京介有著莫名的懷念感。　隔天，到母親墓前的京介遭到(Hospital)殺手的襲擊，被名為壬生シロㄧ的男子所救，並告知有個從未謀面的雙生妹妹琉奈和包括真夜在內有無數複數分身Flicker的存在，還有狙擊琉奈與Flicker的多國籍企業「桐原集團」暗中活動著。後來遇到危險時京介變身成為擁有強大力量的(Soul Taker)，為了保護妹妹和Flicker，還有了解這一切謎團，京介和同伴們踏上旅途。但他沒想到他面對的敵人中還包括著他的親人…